GECO Génomique Computationnelle et Evolutive
Publications
Affichage des publications 31 à 60 sur 1403 au total
Meta-analysis reveals limited reproducibility of lncRNA-related findings in hepatocellular carcinoma research
Pré-publication
voir la publicationThe Inca child of the Quehuar volcano: Stable isotopes clue to geographic origin and seasonal diet, with putative seaweed consumption
Journal of Archaeological Science: Reports . 59 : 104784
Article dans une revue
voir la publicationLook4LTRs: a Long terminal repeat retrotransposon detection tool capable of cross species studies and discovering recently nested repeats
Mobile DNA . 15 ( 1 ) : 8
Article dans une revue
voir la publicationVariation in the fitness impact of translationally optimal codons among animals
Pré-publication
voir la publicationThe porphyran degradation system is complete, phylogenetically and geographically diverse across the gut microbiota of East Asian populations
Pré-publication
voir la publicationParticular sequence characteristics induce bias in the detection of polymorphic transposable element insertions
Pré-publication
voir la publicationSmall ruminants versus endogenous retroviruses: an evolutive showdown still in progress in the domestic goat genome
International congress on transposable elements .
Poster
voir la publicationComputing Thermodynamically Consistent Elementary Flux Modes with Answer Set Programming
CMSB 2024 - 22nd International Conference Computational Methods in Systems Biology . LNCS-14971 : 80-88
Acte de congrès
voir la publicationA genome-wide study of ruminants reveals two endogenous retrovirus families still active in goats
Pré-publication
voir la publicationSMBE Secretary’s Report
Molecular Biology and Evolution . 41 ( 6 )
Article dans une revue
voir la publicationLook4LTRs: a Long terminal repeat retrotransposon detection tool capable of cross species studies and discovering recently nested repeats
Mobile DNA . 15 ( 1 ) : 8
Article dans une revue
voir la publicationDiversité et diversification des Pectobacteriaceae, une famille de bactéries phytopathogènes d’importance mondiale
Cahiers Scientifiques de la Fondation Pierre Vérots . ( 10 ) : 19-29
Article dans une revue
voir la publicationISMB/ECCB 2023 organization benefited from the strengths of the French bioinformatics community
Bioinformatics Advances . 4 ( 1 ) : vbae040
Article dans une revue
voir la publicationBradyrhizobium hardenbergiae sp. nov., isolated from Hardenbergia violacea in Australia, represents a novel basal lineage of the B. elkanii supergroup
Pré-publication
voir la publicationA Wright–Fisher graph model and the impact of directional selection on genetic variation
Theoretical Population Biology . 159 : 13-24
Article dans une revue
voir la publicationInvestigating demic versus cultural diffusion and sex bias in the spread of Austronesian languages in Vietnam
PLoS ONE . 19 ( 6 ) : e0304964
Article dans une revue
voir la publicationComplete mitochondrial genomes of patients from Thailand with cardiovascular diseases
PLoS ONE . 19 ( 7 ) : e0307036
Article dans une revue
voir la publicationGTDrift: a resource for exploring the interplay between genetic drift, genomic and transcriptomic characteristics in eukaryotes
NAR Genomics and Bioinformatics . 6 ( 2 ) : lqae064
Article dans une revue
voir la publicationLogic programming-based Minimal Cut Sets reveal consortium-level therapeutic targets for chronic wound infections
npj Systems Biology and Applications . 10 ( 1 ) : 34
Article dans une revue
voir la publicationRegulatory and evolutionary impact of DNA methylation in two songbird species and their naturally occurring F1 hybrids
BMC Biology . 22 ( 1 ) : 124
Article dans une revue
voir la publicationHigh prevalence of PRDM9-independent recombination hotspots in placental mammals
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 121 ( 23 ) : e2401973121
Article dans une revue
voir la publicationLncRNA analyses reveal increased levels of non-coding centromeric transcripts in hepatocellular carcinoma
Pré-publication
voir la publicationPersistent homology reveals strong phylogenetic signal in 3D protein structures
PNAS Nexus . 3 ( 4 ) : 158
Article dans une revue
voir la publicationThe genetic legacy of the expansion of Bantu-speaking peoples in Africa
Nature . 625 ( 7995 ) : 540–547
Article dans une revue
voir la publicationPRDM9 drives the location and rapid evolution of recombination hotspots in salmonids
Pré-publication
voir la publicationThe role of recombination dynamics in shaping signatures of direct and indirect selection across the Ficedula flycatcher genome
Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 291 ( 2015 ) : 20232382
Article dans une revue
voir la publicationEvidence that genetic drift not adaptation drives fast‐Z and large‐Z effects in Ficedula flycatchers
Molecular Ecology . : e17262
DOI: 10.1111/mec.17262
Article dans une revue
voir la publicationDescription of a new genus of the Pectobacteriaceae family isolated from water in coastal brackish wetlands of the French Camargue region, Prodigiosinella gen. nov., including the new species Prodigiosinella aquatilis sp. nov
Systematic and Applied Microbiology . 47 ( 2-3 ) : 126497
Article dans une revue
voir la publicationMicroAnnot: A Dedicated Workflow for Accurate Microsporidian Genome Annotation
International Journal of Molecular Sciences . 25 ( 2 ) : 880
DOI: 10.3390/ijms25020880
Article dans une revue
voir la publicationIdentification and quantification of transposable element transcripts using Long-Read RNA-seq in Drosophila germline tissues
Peer Community Journal . 4 ( e89 )
Article dans une revue
voir la publication