GECO Génomique Computationnelle et Evolutive
Publications
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Structure, function, and evolution of the Thiomonas spp. genome.
PLoS Genetics . 6 ( 2 ) : e1000859
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voir la publicationA Phylogenetic Model for Investigating Correlated Evolution of Substitution Rates and Continuous Phenotypic Characters
Molecular Biology and Evolution . 28 ( 1 ) : 729 - 744
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voir la publicationA Dirichlet Process Covarion Mixture Model and Its Assessments Using Posterior Predictive Discrepancy Tests
Molecular Biology and Evolution . 27 ( 2 ) : 371-384
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voir la publicationProposals for classification methods dedicated to biological data
International Journal of Biomedical Engineering and Technology (IJBET) . 3 ( 1/2 ) : 4-21
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voir la publicationMetExplore: a web server to link metabolomic experiments and genome-scale metabolic networks.
Nucleic Acids Research . 38 ( Web Server issue ) : W132-7
DOI: 10.1093/nar/gkq312
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voir la publicationGraph-based analysis of the metabolic exchanges between two co-resident intracellular symbionts, Baumannia cicadellinicola and Sulcia muelleri, with their insect host, Homalodisca coagulata.
PLoS Computational Biology . 6 ( 9 ) : epub ahead of print
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voir la publicationThe relationship among gene expression, the evolution of gene dosage, and the rate of protein evolution
PLoS Genetics . 6 ( 5 ) : e1000944
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voir la publicationGenetic Admixture History of Eastern Indonesia as Revealed by Y-Chromosome and Mitochondrial DNA Analysis
Molecular Biology and Evolution . 26 ( 8 ) : 1865-1877
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voir la publicationGenetic diversity and the emergence of ethnic groups in Central Asia
BMC Genetics . 10 ( 1 ) : 49
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voir la publicationMutation Patterns in the Human Genome:More Variable Than Expected
PLoS Biology . 7(2) e1000028 : 803-806
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voir la publicationMonoallelic expression and tissue specificity are associated with high crossover rates
Trends in Genetics . 25(12) : 519-522
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voir la publicationGC-biased gene conversion promotes the fixation of deleterious amino acid changes in primates
Trends in Genetics . 25(1) : 1-5
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voir la publicationSystemic analysis of the symbiotic function of Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid Acyrthosiphon pisum.
Comptes Rendus Biologies . 332 ( 11 ) : 1034-49
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voir la publicationThe Acyrthosiphon pisum Cyc database (AcypiCyc) created using a novel BioCyc Annotation Database System (CycADS): a useful tool to explore and study the pea aphid metabolism
5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2, Barcelona, Espagne, juin 2009 .
Acte de congrès
voir la publicationFootprints of Inversions at Present and Past Pseudoautosomal Boundaries in Human Sex Chromosomes
Genome Biology and Evolution . 1(1) : 56-66
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voir la publicationIdentification of expressed transposable element insertions in the sequenced genome of Drosophila melanogaster
Gene . 439 : 55-62
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voir la publicationAnalysis of fine-scale mammalian evolutionary breakpoints provides new insight into their relation to genome organisation
BMC Genomics . 10 ( 1 ) : 335
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voir la publicationA Mixture Model and a Hidden Markov Model to Simultaneously Detect Recombination Breakpoints and Reconstruct Phylogenies
Evolutionary Bioinformatics . 5 : 67-79
DOI: 10.4137/EBO.S2242
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voir la publicationPhylogeny of prokaryotes: does it exist and why should we care?
Research in Microbiology . 160 : 513-21
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voir la publicationHappy together: genomic insights into the unique Nanoarchaeum/Ignicoccus association.
Journal of Biology . 8 ( 1 ) : 7
DOI: 10.1186/jbiol110
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voir la publicationComplete genome of the cellulolytic thermophile Acidothermus cellulolyticus 11B provides insights into its ecophysiological and evolutionary adaptations
Genome Research . ( 19 ) : 1033-1043
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voir la publicationGenomic environment influences the dynamics of the tirant LTR retrotransposon in Drosophila
FASEB Journal . 23 : 54-62
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voir la publicationInfra- and Transspecific Clues to Understanding the Dynamics of Transposable Elements
genome dyn stab . -- : 115-123
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voir la publicationIdentifying repeats and transposable elements in sequenced genomes: how to find your way through the dense forest of programs
Heredity . -- : 1-14
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voir la publicationThe relationship between DNA replication and human genome organization.
Molecular Biology and Evolution . 26 ( 4 ) : 729-741
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voir la publicationMultiple alignment of biological networks: A flexible approach
Combinatorial Pattern Matching (CPM) . 5577 : 263-273
Acte de congrès
voir la publicationAssessing the exceptionality of coloured motifs in networks
EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology . 2009 : 9 pages on line
DOI: 10.1155/2009/616234
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voir la publicationFast optimization of statistical potentials for structurally constrained phylogenetic models
BMC Evolutionary Biology . 9 ( 1 ) : 227
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voir la publicationComment on “Human-Specific Gain of Function in a Developmental Enhancer”
Science . 323(5915) : 714-715
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voir la publicationBiased Gene Conversion and the Evolution of Mammalian Genomic Landscapes
Annual Review of Genomics and Human Genetics . 10 : 285-311
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