Equipe Génétique et Evolution des Interactions

Membres

Les systèmes vivants sont constitués d’une multitude de niveaux d'organisation imbriqués, impliquant coopération et conflits. La coopération et la sélection de systèmes fonctionnant de manière coordonnée a permis des transitions évolutives dites “majeures”, vers de nouvelles échelles d'individualité, comme la cellule eucaryote. Néanmoins, la sélection naturelle continue à opérer à toutes les échelles, générant de possibles conflits évolutifs entre les différentes composantes de l’individu.

Nos recherches s’inscrivent dans cette perspective, et visent à mieux comprendre la nature et les implications évolutives des interactions entre les multiples composantes des organismes, du gène aux bactéries symbiotiques, en passant par les virus et les éléments transposables. Nous explorons également l’impact de ces interactions sur la dynamique de l’information génétique, à travers le transfert horizontal, ou sur l’innovation génétique et l’adaptation, à travers la domestication. Nos recherches, essentiellement expérimentales, mais également théoriques, sont mises en œuvre sur des modèles arthropodes, et relèvent principalement de la génétique et la génomique évolutive.

L'équipe est structurée en deux grands axes:

  • Interactions intra-génomiques : les éléments transposables (resp. Marie Fablet)
    • Ex1: La dynamique évolutive des éléments transposables (ET) dans les génomes, en lien avec leur variabilité naturelle. Nous utilisons pour modèles des populations naturelles de Drosophila melanogaster et D. simulans, ainsi que des espèces d’intérêt agronomique ou sociétal, telles que l’espèce envahissante D. suzukii ou le moustique tigre Aedes albopictus.
    • Ex2: Les interactions entre le contrôle des ET et l’immunité anti-virale. Nous étudions les mécanismes moléculaires d’interférence ARN à l’origine de l’intrication de ces deux processus, ainsi que les implications co-évolutives, à l’aide d’infections expérimentales de différents virus sur plusieurs lignées de drosophiles.
    • Personnes impliquées : CV, MB, MF
  • La symbiose, moteur de l’évolution (resp. Natacha Kremer)
    • Ex1: Certaines bactéries symbiotiques apportent des capacités métaboliques dont l’insecte est dépourvu. Nous analysons ces interactions chez des insectes hématophages (punaise de lits, tiques) et phytophages (l’aleurode Bemisia tabaci) par des approches combinant analyse des phénotypes, génétique, physiologie et métabolomique.
    • Ex2: Les insectes parasitoïdes ont domestiqué des gènes viraux leur permettant de contourner les réponses immunitaire de leurs hôtes. Nous étudions la fréquence et la signification adaptative de ces évènements et, plus généralement, nous recherchons les facteurs structurant les transferts horizontaux dans les communautés hôtes-parasitoïdes.
    • Personnes impliquées : NK, LM, LZ, JMD, JV, FV, SC

 

 

 

 

Publications

Affichage des publications 331 à 360 sur 460 au total

High Genetic Differentiation between the M and S Molecular Forms of Anopheles gambiae in Africa

C. Esnault, M. Boulesteix, J.B. Duchemin, A.A. Koffi, F. Chandre, R. Dabiré...

PLoS ONE . 3 : 1-7

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You can`t keep a good parasite down: evolution of a male-killer suppressor uncovers cytoplasmic incompatibility

E.A. Hornett, A.M. Duplouy, N. Davies, G.K. Roderick, N. Wedell, G.D. Hurst...

Evolution international journal of organic evolution . 62 : 1258-1263

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The heterochromatic copies of the LTR retrotransposons as a record of the genomic events that have shaped the Drosophila melanogaster genome

N. Mugnier, Laurent Guéguen, Cristina Vieira, C. Biémont

Gene . 411 : 87-93

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Losing helena: The extinction of a drosophila line-like element

Rita Rebollo, Emmanuelle Lerat, Liliana Lopez Kleine, Christian Biémont, Cristina Vieira

BMC Genomics . 9 : 1-11

DOI: 10.1186/1471-2164-9-149

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Intense transpositional activity of insertion sequences in an ancient obligate endosymbiont

R. Cordaux, S. Pichon, A. Ling, P. Perez, C. Delaunay, F. Vavre...

Molecular Biology and Evolution . 25 ( 9 ) : 1889-1896

DOI: 10.1093/molbev/msn134

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Is symbiosis evolution influenced by the pleiotropic role of programmed cell death in immunity an development ?

F. Vavre, N. Kremer, B.A. Pannebakker, B. Loppin, Patrick Mavingui

Insect Symbiosis . 3 : 57-76

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Phylogenetic Characterization and Prevalence of “Spirobacillus cienkowskii ” a Red-Pigmented Spiral-Shaped Bacterial Pathogen of Freshwater Daphnia Species

J.L.M. Rodrigues, M.A. Duffy, A.J. Tessier, D. Ebert, L. Mouton, T.M. Schmidt

Applied and Environmental Microbiology . 74 : 1575-1582

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The effects of multiple infections on the expression and evolution of virulence in a daphnia-endoparasite system

F. Ben-Ami, L. Mouton, D. Ebert

Evolution - International Journal of Organic Evolution . 62-7 : 1700-1711

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The evolution of retrotransposon regulatory regions and its consequences on the Drosophila melanogaster and Homo sapiens host genomes

Marie Fablet, Rita Rebollo, Christian Biémont, Cristina Vieira

Gene . 390 ( 1-2 ) : 84-91

DOI: 10.1016/j.gene.2006.08.005

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Behavioural manipulation of insect parasitoids by a maternally inherited virus: ecological consequences and potential applications for biological control

Julien Varaldi, S. Patot, M. Maache, D. Lepetit, Frédéric Fleury

Entomological Research . 37 : A11-A73

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Evolution and invasion dynamics of multiple infections with Wolbachia investigated using matrix based models.

E. Vautrin, Sandrine Charles, S. Genieys, F. Vavre

Journal of Theoretical Biology . 245 : 197-209

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Parasitic inhibition of cell death facilitates symbiosis.

Bart A Pannebakker, Benjamin Loppin, Coen P H Elemans, Lionel Humblot, Fabrice Vavre

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 104 ( 1 ) : 213-5

DOI: 10.1073/pnas.0607845104

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Tomato yellow leaf curl virus transmission efficacy is determined by symbiotic bacteria in the vector the sweet potato whitefly Bemisia tabaci

E. Zchori-Fein, Y.. Gottlieb, H. Czosnek, E. Chiel, F. Vavre, Frédéric Fleury...

Entomological Research . 37(1) : A42-A43

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A Survey of the Bacteriophage WO in the Endosymbiotic Bacteria Wolbachia

L. Gavotte, H. Henri, R. Stouthamer, D. Charif, S. Charlat, M. Boulétreau...

Molecular Biology and Evolution . 24 : 427-435

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Variable-Number Tandem Repeats as Molecular Markers for Biotypes of Pasteuria ramosa in Daphnia spp

L. Mouton, G. Nong, J.F. Preston, D. Ebert

Applied and Environmental Microbiology . 73 : 3715-3718

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Evolutionary Pathways of the tirant LTR Retrotransposon in the Drosophila melanogaster Subgroup of Species

M. Fablet, S. Souames, C. Biémont, Cristina Vieira

Journal of Molecular Evolution . 64 : 438-447

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Male-killing bacteria trigger a cycle of increasing male fatigue and female promiscuity

S. Charlat, M. Reuter, E.A. Dyson, E.A. Hornett, A. Duplouy, N. Davies...

Current Biology . 17 : 273-277

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Male rarity and putative sex-role reversal in Fijian damselflies (Odonata)

H. van Gossum, C.D. Beatty, S. Charlat, H. Waqa, T. Markwell, J.H. Skevington...

Journal of Tropical Ecology . 23 : 591-598

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The effects of age at mating on female life-history traits in a seed beetle

A.A. Maklakov, N. Kremer, G. Arnqvist

Behavioral Ecology . 18 : 551-555

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The Sublethal Effects of Pesticides on Beneficial Arthropods

N. Desneux, A. Decourtye, Jean-Marie Delpuech

Annual Review of Entomology . 52 : 81-106

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Interaction between host genotype and environmental conditions affects bacterial density in Wolbachia symbiosis

L. Mouton, H. Henri, D. Charif, M. Boulétreau, F. Vavre

Biology Letters . 3 : 210-213

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Reverse Arrangement of rRNA Subunits in the Microsporidium Glugoides intestinalis

D. Refardt, L. Mouton

Journal of Eukaryotic Microbiology . 54 : 83-85

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Insertion polymorphism of transposable elements and population structure of Anopheles gambiae M and S molecular forms in Cameroon

M. Boulesteix, F. Simard, C. Antonio-Nkondjio, P. Awono-Ambene, D. Fontenille, C. Biémont

Molecular Ecology . 16 : 441-452

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Disrupting the timing of Wolbachia-induced male-killing

S. Charlat, N. Davies, G.K. Roderick, G.D. Hurst

Biology Letters . 3 : 154-156

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Extraordinary flux in sex ratio

Sylvain Charlat, Emily Hornett, James Fullard, Neil Davies, George Roderick, Nina Wedell...

Science . 317 ( 5835 ) : 214-214

DOI: 10.1126/science.1143369

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Mitspieler der Evolution

C. Biémont, Cristina Vieira

Spektrum der Wissenschaft . S44 : 44-49

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Artifical transfer and morphological description of virus particles associated with superparasitism behaviour in a parasitoid wasp.

Julien Varaldi, M. Ravallec, C. Labrosse, M. Lopez-Ferber, M. Boulétreau, Frédéric Fleury

Journal of Insect Physiology . 52 ( 11-12 ) : 1202-1212

DOI: 10.1016/j.jinsphys.2006.09.002

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Superparasitism evolution: adaptation or manipulation?

Sylvain Gandon, Ana R Rivero, Julien Varaldi

The American Naturalist . 167 ( 1 ) : E1-E22

DOI: 10.1086/498398

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The virus infecting the parasitoid Leptopilina boulardi exerts a specific action on superparasitism behaviour

Julien Varaldi, S. Petit, M. Boulétreau, Frédéric Fleury

Parasitology . 132 : 747-756

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Ongoing loss of the tirant transposable element in natural populations of Drosophila simulans

M. Fablet, J.F. Donald, C. Biémont, Cristina Vieira

Gene . 375 : 54-62

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