GECO Génomique Computationnelle et Evolutive

Equipe Bioinformatique, Phylogénie et Génomique Évolutive

Equipe Baobab

Publications

Affichage des publications 781 à 810 sur 1197 au total

Suppression of Long-Branch Attraction Artefacts in the Animal Phylogeny Using a Site-Heterogeneous Model

Nicolas Lartillot, Henner Brinkmann, Herve Philippe

BMC Evolutionary Biology . 7 ( Suppl 1 ) : S4

DOI: 10.1186/1471-2148-7-S1-S4

Article dans une revue

voir la publication

A New Method for Assessing the Effect of Replication on DNA Base Composition Asymmetry

A. Necşulea, J.R. Lobry

incollection . 7 : 379-381

Article dans une revue

voir la publication

Maintenance in the chicken genome of the retroviral-like cENS gene family specifically expressed in early embryos

Emmanuelle Lerat, Anne-Marie Birot, Jacques Samarut, Anne Mey

Journal of Molecular Evolution . 65 ( 3 ) : 215-227

DOI: 10.1007/s00239-007-9001-4

Article dans une revue

voir la publication

Predictions for whole genome 2D display according to size and sequence composition

Bénédicte Lafay, Jean-François Mercier, Christine Kingsburry, Gary W. Slater

3rd SCOPE meeting on Microbial Environmental Genomics (MicroEnGenIII ) .

Acte de congrès

voir la publication

Genetic diversity and phylogeographic clustering of SIVcpzPtt in wild chimpanzees in Cameroon.

Fran van Heuverswyn, Yingying Li, Elizabeth Bailes, Cecile Neel, Bénédicte Lafay, Brandon F Keele...

Virology . 368 ( 1 ) : 155-71

DOI: 10.1016/j.virol.2007.06.018

Article dans une revue

voir la publication

Prevalence and genetic diversity of simian immunodeficiency virus infection in wild red colobus Monkeys (Piliocolobus badius badius) from the Taï Forest, Côte d'Ivoire

Sabrina Locatelli, Florian Liegeois, Bénédicte Lafay, Amy D Roeder, M. W. Bruford, Pierre Formenty...

2nd Congress of the European Federation of Primatology .

Acte de congrès

voir la publication

Molecular characterization of a simian immunodeficiency virus lineage (SIVwrc) from western red colobus (Piliocolobus badius badius)

Florian Liegeois, Sabrina Locatelli, Bénédicte Lafay, Pierre Formenty, Valérie Courgnaud, Eric Delaporte...

14th International Workshop of HIV Dynamics & Evolution .

Acte de congrès

voir la publication

Simian immunodeficiency virus infection in wildliving red colobus monkey (Piliocolobus badius badius) from the Taï forest, Côte D'Ivoire

Sabrina Locatelli, Florian Liegeois, Bénédicte Lafay, A.D. Roeder, M. W. Bruford, R. Noë...

14th International Workshop of HIV Dynamics & Evolution .

Acte de congrès

voir la publication

Molecular diversity of legume root-nodule bacteria in Kakadu National Park, Northern Territory, Australia.

Bénédicte Lafay, Jeremy J Burdon

PLoS ONE . 2 ( 3 ) : e277

DOI: 10.1371/journal.pone.0000277

Article dans une revue

voir la publication

Identification and characterization of human Mex-3 proteins, a novel family of evolutionarily conserved RNA-binding proteins differentially localized to processing bodies.

Karine Buchet-Poyau, Julien Courchet, Hervé Le Hir, Bertrand Séraphin, Jean-Yves Scoazec, L. Duret...

Nucleic Acids Research . 35 ( 4 ) : 1289-300

DOI: 10.1093/nar/gkm016

Article dans une revue

voir la publication

Investigating the effects of prehistoric migrations in Siberia: genetic variation and the origins of Yakuts

Brigitte Pakendorf, Innokentij Novgorodov, Vladimir Osakovskij, Al’bina Danilova, Artur Protod’jakonov, Mark Stoneking

Human Genetics . 120 ( 3 ) : 334-353

Article dans une revue

voir la publication

Melanesian and Asian origins of Polynesians: mtDNA and Y chromosome gradients across the Pacific

M. Kayser, S. Brauer, R. Cordaux, A. Casto, O. Lao, L.A. Zhivotovsky...

Molecular Biology and Evolution . 23 : 2234-2244

Article dans une revue

voir la publication

Mycotoxin fumonisin B-1 selectively down-regulates the basal IL-8 expression in pig intestine: in vivo and in vitro studies

S Bouhet, E Le Dorze, Sabine Pérès, Jm Fairbrother, Isabelle P. Oswald

Food and Chemical Toxicology . 44 ( 10 ) : 1768-1773

Article dans une revue

voir la publication

Global trends of whole genome duplications revealed by the genome sequence of the ciliate Paramecium tetraurelia

Jean-Marc Aury, Olivier Jaillon, * Laurent Duret, Benjamin Noel, Claire Jubin, Betina M. Porcel...

Nature . 444 ( 7116 ) : 171-178

DOI: 10.1038/nature05230

Article dans une revue

voir la publication

GC Content Evolution of the Human and Mouse Genomes : Insights from the Study of Processed Pseudogenes in Regions of Different Recombination Rates.

A. Khelifi, J. Meunier, L. Duret, Dominique Mouchiroud

Journal of Molecular Evolution . 62 : 745-752

Article dans une revue

voir la publication

Insights into social insects from the genome of the honeybee Apis mellifera

G.M. Weinstock, G.E. Robinson, R.A. Gibbs, K.C. Worley, J.D. Evans, R. Maleszka...

Nature . 443 : 931-949

Article dans une revue

voir la publication

Uncovering structure in biological networks

J.J. Daudin, Vincent Lacroix, M. Mariadassou, V. Miele, Franck Picard, S. Robin...

incollection . -- : 471-483

Article dans une revue

voir la publication

Motif search in graphs: application to metabolic networks.

Vincent Lacroix, C.G. Fernandes, M.-F. Sagot

IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics . 3 - n°4 : 360-368

Article dans une revue

voir la publication

Longest Repeats with a Block of k Don't Cares

Maxime Crochemore, Costas S. Iliopoulos, Manal Mohamed, Marie-France Sagot

Theoretical Computer Science . 362 ( 1-3 ) : 248-254

DOI: 10.1016/j.tcs.2006.06.029

Article dans une revue

voir la publication

Origin and molecular evolution of receptor tyrosine kinases with immunoglobulin-like domains.

Julien Grassot, Manolo Gouy, Guy Perrière, Guy Mouchiroud

Molecular Biology and Evolution . 23 ( 6 ) : 1232-41

DOI: 10.1093/molbev/msk007

Article dans une revue

voir la publication

Efficient Likelihood Computations with Nonreversible Models of Evolution

Bastien Boussau, Manolo Gouy

Systematic Biology . 55 ( 5 ) : 756-768

DOI: 10.1080/10635150600975218

Article dans une revue

voir la publication

Phylogeography of a subterranean amphipod reveals cryptic diversity and dynamic evolution in extreme environments

T. Lefébure, C.J. Douady, Manolo Gouy, P. Trontel, J. Briolay, J. Gibert

Molecular Ecology . 15 : 1797-1806

DOI: 10.1111/j.1365-294X.2006.02888.x

Article dans une revue

voir la publication

Mycobacterium bovis Infection

S. Mignard, Jean-Pierre Flandrois

Journal of Medical Microbiology . 56 : 1033-1041

Article dans une revue

voir la publication

Molecular diversity of rhizobia nodulating the invasive legume Cytisus scoparius in Australia.

Bénédicte Lafay, Jeremy J. Burdon

Journal of Applied Microbiology . 100 ( 6 ) : 1228-38

DOI: 10.1111/j.1365-2672.2006.02902.x

Article dans une revue

voir la publication

Bradyrhizobia isolated from root nodules of Parasponia (Ulmaceae) do not constitute a separate coherent lineage.

Bénédicte Lafay, Erika Bullier, Jeremy J. Burdon

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 56 ( Pt 5 ) : 1013-8

DOI: 10.1099/ijs.0.63897-0

Article dans une revue

voir la publication

A maximum likelihood framework for protein design

Claudia Kleinman, Nicolas Rodrigue, Cécile Bonnard, Hervé Philippe, Nicolas Lartillot

BMC Bioinformatics . 7 : 326-336

DOI: 10.1186/1471-2105-7-326

Article dans une revue

voir la publication

Quantitative prediction for two-dimensional bacterial genomic displays

Jean-François Mercier, Bénédicte Lafay, Gary W. Slater

American Physical Society Meeting .

Acte de congrès

voir la publication

No Evidence for Tissue-Specific Adaptation of Synonymous Codon Usage in Humans

M. Sémon, J.R. Lobry, L. Duret

Molecular Biology and Evolution . 23 : 523-529

Article dans une revue

voir la publication