GECO Génomique Computationnelle et Evolutive
Publications
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Evolution des organismes bactériens
Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant" . : 1-1
Acte de congrès
voir la publicationCaractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisum
Séminaire INRA AgroBI . : 1-1
Acte de congrès
voir la publicationA multiple layer model to compare RNA secondary structures
Software: Practice and Experience . 38 ( 8 ) : 775-792
DOI: 10.1002/spe.846
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voir la publicationIndexing gapped-factors using a tree
International Journal of Foundations of Computer Science . 19 ( 1 ) : 71-87
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voir la publicationLossless filter for multiple repetitions with Hamming distance
Journal of Discrete Algorithms . 6 ( 3 ) : 497-509
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voir la publicationPrecise detection of rearrangement breakpoints in mammalian chromosomes
BMC Bioinformatics . 9 ( 1 ) : 286
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voir la publicationDevelopment of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc): from genome sequence to metabolic network analyses
Integrative Post-Genomics - IPG'08 . : 1-1
Acte de congrès
voir la publicationAnnotation of metabolism genes: towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses
4th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1" . : 1-1
Acte de congrès
voir la publicationDémasquage des gènes spécifiques d'une espèce génomique du complexeAgrobacterium tumefaciens par AFLP et multicapteur à ADN
7. Colloque national du Bureau des Ressources Génétiques . 7
Acte de congrès
voir la publicationAutomatic Identification of Large Collections of Protein-Coding or rRNA Sequences
Biochimie . 90 ( 4 ) : 609-614
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voir la publicationBioinformatics in the complete genome sequence era
Biochimie . 90 : 553-554
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voir la publicationAccounting for horizontal gene transfers explains conflicting hypotheses regarding the position of aquificales in the phylogeny of Bacteria
BMC Evolutionary Biology . 8 : 272-272
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voir la publicationA seven-gene multilocus genus-wide approach to the phylogeny of mycobacteria using supertrees
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 58(part 6) : 1432-1441
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voir la publicationExact Transcriptome Reconstruction from Short Sequence Reads
International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI) . 5251 : 50-63
Acte de congrès
voir la publicationIdentification de motifs dans les réseaux métaboliques : définitions algorithmes et application au métabolisme d’Escherichia coli
Edilivre . 978-2-35607-642-7
Ouvrage
voir la publicationMesophilic crenarchaeota: proposal for a third archaeal phylum, the Thaumarchaeota.
Nature Reviews Microbiology . 6 ( 3 ) : 245-252
DOI: 10.1038/nrmicro1852
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voir la publicationA DNA topoisomerase IB in Thaumarchaeota testifies for the presence of this enzyme in the last common ancestor of Archaea and Eucarya.
Biol Direct . 3 : 54
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voir la publicationLes Archaea : évolution et diversité du troisième domaine du vivant
Bulletin - Société Française de Microbiologie . 23 ( 3 ) : 137-145
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voir la publicationMetagenome Annotation Using a Distributed Grid of Undergraduate Students
PLoS Biology . 6 : 239-241
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voir la publicationFull molecular characterization of a simian immunodeficiency virus, SIVwrcpbt from Temminck's red colobus (Piliocolobus badius temminckii) from Abuko Nature Reserve, The Gambia
Virology . 376 ( 1 ) : 90-100
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voir la publicationPrevalence and genetic diversity of simian immunodeficiency virus infection in wild-living red colobus monkeys (Piliocolobus badius badius) from the Taï forest, Côte d'Ivoire SIVwrc in wild-living western red colobus monkeys.
Infection, Genetics and Evolution . 8 ( 1 ) : 1-14
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voir la publicationA Site- and Time-Heterogeneous Model of Amino Acid Replacement
Molecular Biology and Evolution . 25 ( 5 ) : 842-858
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voir la publicationAdditional molecular support for the new chordate phylogeny.
Genesis - The Journal of Genetics and Development . 46 ( 11 ) : 592-604
DOI: 10.1002/dvg.20450
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voir la publicationEmpirical Profile Mixture Models for Phylogenetic Reconstruction
Bioinformatics . 29 : 2317-2323
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voir la publicationParallel Adaptations to High Temperatures in the Archean Eon
Nature . 456 ( 7224 ) : 942-945
DOI: 10.1038/nature07393
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voir la publicationAnalyse et exploitation de la diversité génétique des polykétides synthases de type I dans l'ADN metagénomique d'un sol
7ème colloque national "Ressources génétiques" . : 201-213
Acte de congrès
voir la publicationGenome-wide studies highlight indirect links between human replication origins and gene regulation.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 105 ( 41 ) : 15837-42
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voir la publicationEvolution of the proteome of mitochondrial ribosomes: a clue for the eukaryotic tree?
Journées Ouvertes Biologie Informatique et Mathématiques JOBIM .
Poster
voir la publicationPopulation genetic inference using a fixed number of segregating sites : a reassessment
Genetical Research . 89 : 231-244
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