Equipe Génétique et Evolution des Interactions
Membres
Ingénieur d'études CDD
CNRS
Maître de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 16
Post-doc
CNRS
Chargé de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 44 81 01
Post-doc
CNRS
Chargé de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 43 29 12
Maîtresse de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 16
Professeur des universités
UCBL
Doctorante
CNRS
Tél : 04 72 44 81 42
Doctorant
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Post-doc
CNRS
Chargée de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 44 81 01
Doctorante
INSA
Tél : 04 72 44 81 42
Post-doc
CNRS
Maîtresse de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 10
Doctorante
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Doctorante
UCBL
Stagiaire
UCBL
Doctorante
UCBL
Stagiaire
UCBL
Maître de conférences
UCBL
Tél : 33 04 72 44 81 01
Directeur de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 43 19 21
Professeure des universités
UCBL
Tél : 33 04 72 44 82 16
Doctorant
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Professeur des universités
VetAgro-Sup
Tél : 33 04 78 87 27 02
Les systèmes vivants sont constitués d’une multitude de niveaux d'organisation imbriqués, impliquant coopération et conflits. La coopération et la sélection de systèmes fonctionnant de manière coordonnée a permis des transitions évolutives dites “majeures”, vers de nouvelles échelles d'individualité, comme la cellule eucaryote. Néanmoins, la sélection naturelle continue à opérer à toutes les échelles, générant de possibles conflits évolutifs entre les différentes composantes de l’individu.
Nos recherches s’inscrivent dans cette perspective, et visent à mieux comprendre la nature et les implications évolutives des interactions entre les multiples composantes des organismes, du gène aux bactéries symbiotiques, en passant par les virus et les éléments transposables. Nous explorons également l’impact de ces interactions sur la dynamique de l’information génétique, à travers le transfert horizontal, ou sur l’innovation génétique et l’adaptation, à travers la domestication. Nos recherches, essentiellement expérimentales, mais également théoriques, sont mises en œuvre sur des modèles arthropodes, et relèvent principalement de la génétique et la génomique évolutive.
L'équipe est structurée en deux grands axes:
- Interactions intra-génomiques : les éléments transposables (resp. Marie Fablet)
- Ex1: La dynamique évolutive des éléments transposables (ET) dans les génomes, en lien avec leur variabilité naturelle. Nous utilisons pour modèles des populations naturelles de Drosophila melanogaster et D. simulans, ainsi que des espèces d’intérêt agronomique ou sociétal, telles que l’espèce envahissante D. suzukii ou le moustique tigre Aedes albopictus.
- Ex2: Les interactions entre le contrôle des ET et l’immunité anti-virale. Nous étudions les mécanismes moléculaires d’interférence ARN à l’origine de l’intrication de ces deux processus, ainsi que les implications co-évolutives, à l’aide d’infections expérimentales de différents virus sur plusieurs lignées de drosophiles.
- Personnes impliquées : CV, MB, MF
- La symbiose, moteur de l’évolution (resp. Natacha Kremer)
- Ex1: Certaines bactéries symbiotiques apportent des capacités métaboliques dont l’insecte est dépourvu. Nous analysons ces interactions chez des insectes hématophages (punaise de lits, tiques) et phytophages (l’aleurode Bemisia tabaci) par des approches combinant analyse des phénotypes, génétique, physiologie et métabolomique.
- Ex2: Les insectes parasitoïdes ont domestiqué des gènes viraux leur permettant de contourner les réponses immunitaire de leurs hôtes. Nous étudions la fréquence et la signification adaptative de ces évènements et, plus généralement, nous recherchons les facteurs structurant les transferts horizontaux dans les communautés hôtes-parasitoïdes.
- Personnes impliquées : NK, LM, LZ, JMD, JV, FV, SC
Publications
Affichage des publications 91 à 120 sur 460 au total
The transposable element-rich genome of the cereal pest Sitophilus oryzae
BMC Biology . 19 ( 1 ) : 241
Article dans une revue
voir la publicationChromosomal scale assembly of parasitic wasp genome reveals symbiotic virus colonization
Communications Biology . 4 ( 1 ) : 1-15
Article dans une revue
voir la publicationIn vivo MRI characterization of the Xlf-/- mouse model of genetic radiosensitivity following low-dose in utero irradiation
European Society for Magnetic Resonance in Medicine and Biology (ESMRMB Congress 2020) .
Acte de congrès
voir la publicationLa tête de « Jupiter capitolin » de Fréjus (Forum Iulii)
Revue archéologique de Narbonnaise . ( 53 ) : 239-266
Article dans une revue
voir la publicationGenomic Analysis of European Drosophila melanogaster Populations Reveals Longitudinal Structure, Continent-Wide Selection, and Previously Unknown DNA Viruses
Molecular Biology and Evolution . 37 ( 9 ) : 2661-2678
Article dans une revue
voir la publicationSuperparasitism by a parasitoid wasp: The absence of sublethal effects from the neonicotinoid insecticide imidacloprid enlightens the specificity of the cholinergic pathway involved
Ecotoxicology and Environmental Safety . 201 : 110809
Article dans une revue
voir la publicationEndosymbiont diversity in natural populations of Tetranychus mites is rapidly lost under laboratory conditions
Heredity . 124 ( 4 ) : 603-617
Article dans une revue
voir la publicationCombining sterile and incompatible insect techniques for the population suppression of Drosophila suzukii
Journal of Pest Science . 93 ( 2 ) : 647 - 661
Article dans une revue
voir la publicationHow consistent is RAD‐seq divergence with DNA‐barcode based clustering in insects?
Molecular Ecology Resources . 20 ( 5 ) : 1294-1298
Article dans une revue
voir la publicationHomology-Free Detection of Transposable Elements Unveils Their Dynamics in Three Ecologically Distinct Rhodnius Species
Genes . 11 ( 2 ) : 170
Article dans une revue
voir la publicationStress & Symbiosis: Heads or Tails?
Frontiers in Ecology and Evolution . : 1-9
Article dans une revue
voir la publicationY chromosome makes fruit flies die younger
Peer Community In Evolutionary Biology . : 100105
Autre publication
voir la publicationA behavior-manipulating virus relative as a source of adaptive genes for Drosophila parasitoids
Molecular Biology and Evolution . 37 ( 10 ) : 2791-2807
Article dans une revue
voir la publicationExperimental evolution of virulence and associated traits in a Drosophila melanogaster - Wolbachia symbiosis
Peer Community In Evolutionary Biology . : e9
DOI: 10.24072/pcjournal.9
Article dans une revue
voir la publicationInsects and incest: Sib‐mating tolerance in natural populations of a parasitoid wasp
Molecular Ecology . 29 ( 3 ) : 596-609
DOI: 10.1111/mec.15340
Article dans une revue
voir la publicationTransposable elements in Drosophila
Mobile DNA . 11 ( 1 )
Article dans une revue
voir la publicationA transposon story : from TE content to TE dynamic invasion of Drosophila genomes using the single-molecule sequencing technology from Oxford Nanopore
Cells . 9 ( 8 ) : 1776
DOI: 10.3390/cells9081776
Article dans une revue
voir la publicationViral infection impacts transposable element transcript amounts in Drosophila
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 117 ( 22 ) : 12249-12257
Article dans une revue
voir la publicationSyndrome de Klinefelter, rôle du chromosome Y dans l’espérance de vie humaine ?
36ème Congrès de la Société Française d'Endocrinologie (SFE Marseille 2020) . 81 ( 4 ) : 194
Acte de congrès
voir la publicationWolbachia host shifts: routes, mechanisms, constraints and evolutionary consequences
Biological Reviews .
DOI: 10.1111/brv.12663
Article dans une revue
voir la publicationL’épistémologie des sciences biologiques et géologiques : une occasion d’enseigner l’incertitude ?
Raisons éducatives . N°24
Article dans une revue
voir la publicationDrosophila suzukii oxidative stress response involves Jheh gene cluster but not transposable elements
Pré-publication
voir la publicationBiological Invasion: The Influence of the Hidden Side of the (Epi)Genome
Functional Ecology . 34 ( 2 ) : 385-400
Article dans une revue
voir la publicationChromosomal resolution reveals symbiotic virus colonization of parasitic wasp genomes
Pré-publication
voir la publicationSome evolutionary insights into an accidental homing endonuclease passage from mitochondria to the nucleus
Peer Community In Evolutionary Biology . : 100101
Autre publication
voir la publicationDéveloppement d’approches métabolomiques pour étudier la contribution des symbiotes à l’exploitation et à la spécialisation de niche de Bemisia tabaci, insecte invasif ravageur de cultures
Journées d’échanges - Fédération BioEnvironnement et Santé .
Poster
voir la publicationTransposable element dynamics and regulation in a major crop pest: Sitophilus oryzae.
Congrès national sur les éléments transposables .
Poster
voir la publicationDiscovering the link between insect symbiosis and transposable elements.
Crossroads between transposons and gene regulation .
Poster
voir la publicationInfluence of bacterial symbionts on host niche and ecological diversification: a metabolic approach in a whitefly model.
Auvergne Rhône-Alpes Regional Workshop on Microbiome .
Poster
voir la publicationInfluence of bacterial symbionts on host niche and ecological diversification: a metabolic approach in a whitefly model.
Colloque Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID) et le réseau Immunologie des Invertébrés (IMMUNINV) .
Poster
voir la publication