Equipe Génétique et Evolution des Interactions
Membres
Ingénieur d'études CDD
CNRS
Maître de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 16
Post-doc
CNRS
Chargé de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 44 81 01
Chargé de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 43 29 12
Maîtresse de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 16
Professeur des universités
UCBL
Post-doc
CNRS
Doctorante
CNRS
Tél : 04 72 44 81 42
Doctorant
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Post-doc
CNRS
Chargée de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 44 81 01
Doctorante
INSA
Tél : 04 72 44 81 42
Post-doc
UCBL
Maîtresse de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 10
Assistante ingénieure CDD
CNRS
Tél : 04 72 44 81 42
Doctorante
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Doctorante
UCBL
Doctorante
UCBL
Assistante ingénieure CDD
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Maître de conférences
UCBL
Tél : 33 04 72 44 81 01
Directeur de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 43 19 21
Professeure des universités
UCBL
Tél : 33 04 72 44 82 16
Doctorant
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Professeur des universités
VetAgro-Sup
Tél : 33 04 78 87 27 02
Les systèmes vivants sont constitués d’une multitude de niveaux d'organisation imbriqués, impliquant coopération et conflits. La coopération et la sélection de systèmes fonctionnant de manière coordonnée a permis des transitions évolutives dites “majeures”, vers de nouvelles échelles d'individualité, comme la cellule eucaryote. Néanmoins, la sélection naturelle continue à opérer à toutes les échelles, générant de possibles conflits évolutifs entre les différentes composantes de l’individu.
Nos recherches s’inscrivent dans cette perspective, et visent à mieux comprendre la nature et les implications évolutives des interactions entre les multiples composantes des organismes, du gène aux bactéries symbiotiques, en passant par les virus et les éléments transposables. Nous explorons également l’impact de ces interactions sur la dynamique de l’information génétique, à travers le transfert horizontal, ou sur l’innovation génétique et l’adaptation, à travers la domestication. Nos recherches, essentiellement expérimentales, mais également théoriques, sont mises en œuvre sur des modèles arthropodes, et relèvent principalement de la génétique et la génomique évolutive.
L'équipe est structurée en deux grands axes:
- Interactions intra-génomiques : les éléments transposables (resp. Marie Fablet)
- Ex1: La dynamique évolutive des éléments transposables (ET) dans les génomes, en lien avec leur variabilité naturelle. Nous utilisons pour modèles des populations naturelles de Drosophila melanogaster et D. simulans, ainsi que des espèces d’intérêt agronomique ou sociétal, telles que l’espèce envahissante D. suzukii ou le moustique tigre Aedes albopictus.
- Ex2: Les interactions entre le contrôle des ET et l’immunité anti-virale. Nous étudions les mécanismes moléculaires d’interférence ARN à l’origine de l’intrication de ces deux processus, ainsi que les implications co-évolutives, à l’aide d’infections expérimentales de différents virus sur plusieurs lignées de drosophiles.
- Personnes impliquées : CV, MB, MF
- La symbiose, moteur de l’évolution (resp. Natacha Kremer)
- Ex1: Certaines bactéries symbiotiques apportent des capacités métaboliques dont l’insecte est dépourvu. Nous analysons ces interactions chez des insectes hématophages (punaise de lits, tiques) et phytophages (l’aleurode Bemisia tabaci) par des approches combinant analyse des phénotypes, génétique, physiologie et métabolomique.
- Ex2: Les insectes parasitoïdes ont domestiqué des gènes viraux leur permettant de contourner les réponses immunitaire de leurs hôtes. Nous étudions la fréquence et la signification adaptative de ces évènements et, plus généralement, nous recherchons les facteurs structurant les transferts horizontaux dans les communautés hôtes-parasitoïdes.
- Personnes impliquées : NK, LM, LZ, JMD, JV, FV, SC
Publications
Affichage des publications 151 à 180 sur 445 au total
The global impact of Wolbachia on mitochondrial diversity and evolution
Journal of Evolutionary Biology . 30 ( 12 ) : 2204-2210
DOI: 10.1111/jeb.13186
Article dans une revue
voir la publicationElicitation of superparasitization behavior from the parasitoid wasp Leptopilina boulardi by the organophosphorus insecticide chlorpyrifos
Science of the Total Environment . 580 : 907-911
Article dans une revue
voir la publicationEvolutionary changes in symbiont community structure in ticks
Molecular Ecology . 26 ( 11 ) : 2905–2921
DOI: 10.1111/mec.14094
Article dans une revue
voir la publicationSusceptibility of MED-Q1 and MED-Q3 Biotypes of Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae) Populations to Essential and Seed Oils
Journal of Economic Entomology . 110 ( 3 ) : 1031 - 1038
DOI: 10.1093/jee/tox100
Article dans une revue
voir la publicationSelf and Nonself from a Genomic Perspective: Transposable Elements
Evolutionary Biology: Self/Nonself Evolution, Species and Complex Traits Evolution, Methods and Concepts . 2 ( 5 ) : 111-128
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationA newly evolved W(olbachia) sex chromosome in pillbug!
Peer Community In Evolutionary Biology .
Article dans une revue
voir la publicationA DNA barcode-based survey of terrestrial arthropods in the Society Islands of French Polynesia: host diversity within the SymbioCode Project
European Journal of Taxonomy . 272 : 1-13
DOI: 10.5852/ejt.2017.272
Article dans une revue
voir la publicationTransposable Element Misregulation Is Linked to the Divergence between Parental piRNA Pathways in Drosophila Hybrids
Genome Biology and Evolution . 9 ( 6 ) : 1450 - 1470
DOI: 10.1093/gbe/evx091
Article dans une revue
voir la publicationHooked on Wolbachia
Peer Community In Evolutionary Biology .
Article dans une revue
voir la publicationAdaptation-adaptabilité : comprendre la réponse adaptative avec pour objectif de la prédire
Prospectives de l’Institut Ecologie et environnement du CNRS : compte-rendu des journées des 22, 23 et 24 février 2017, CNRS, Bordeaux, CNRS . : 127-141
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationIdentification of misexpressed genetic elements in hybrids between Drosophila-related species
Scientific Reports . 7 : 40618
DOI: 10.1038/srep40618
Article dans une revue
voir la publicationLess effective selection leads to larger genomes
Genome Research . 27 : 1016-1028
Article dans une revue
voir la publicationHow Long Does Wolbachia Remain on Board?
Molecular Biology and Evolution . 34 ( 5 ) : 1183 - 1193
Article dans une revue
voir la publicationImpact of Wolbachia on oxidative stress sensitivity in the parasitic wasp Asobara japonica
PLoS ONE . 5 : 10
Article dans une revue
voir la publicationDiploid male production correlates with genetic diversity in the parasitoid wasp Venturia canescens : a genetic approach with new microsatellite markers
Ecology and Evolution . 6 ( 18 ) : 6721 - 6734
DOI: 10.1002/ece3.2370
Article dans une revue
voir la publicationPopulation genetics of the Asian tiger mosquito Aedes albopictus, an invasive vector of human diseases
Heredity . 117 ( 3 ) : 125-34
DOI: 10.1038/hdy.2016.35
Article dans une revue
voir la publicationHow and how much does RAD-seq bias genetic diversity estimates?
BMC Evolutionary Biology . 16 : 240
Article dans une revue
voir la publicationAdditional heritable virus in the parasitic wasp Leptopilina boulardi: prevalence, transmission and phenotypic effects
Journal of General Virology . 97 : 523-535
DOI: 10.1099/jgv.0.000360
Article dans une revue
voir la publicationSNP calling from RNA-seq data without a reference genome: identification, quantification, differential analysis and impact on the protein sequence
Nucleic Acids Research .
DOI: 10.1093/nar/gkw655
Article dans une revue
voir la publicationInfluence of oxidative homeostasis on bacterial density and cost of infection in Drosophila–Wolbachia symbioses
Journal of Evolutionary Biology . 29 : 1211-1222
DOI: 10.1111/jeb.12863
Article dans une revue
voir la publicationWolbachia -mediated protection against viruses in the invasive pest Drosophila suzukii
Insect Molecular Biology . 25 ( 5 ) : 595-603
DOI: 10.1111/imb.12245
Article dans une revue
voir la publicationWolbachia in European Populations of the Invasive Pest Drosophila suzukii: Regional Variation in Infection Frequencies
PLoS ONE . 11 ( 1 ) : e0147766
Article dans une revue
voir la publicationThe draft genome sequence of the rice weevil Sitophilus oryzae as a model to explore the host-symbiont interactions in a nascent stage of endosymbiosis
Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM) .
Poster
voir la publicationDrosophila Females Undergo Genome Expansion after Interspecific Hybridization
Genome Biology and Evolution . 8 ( 3 ) : 556-561
DOI: 10.1093/gbe/evw024
Article dans une revue
voir la publicationIs genome size of Lepidoptera linked to host plant range?
Entomologia Experimentalis et Applicata . 159 ( 3 ) : 354-361
DOI: 10.1111/eea.12446
Article dans une revue
voir la publicationThe sublethal effects of endosulfan on the circadian rhythms and locomotor activity of two sympatric parasitoid species
Chemosphere . 132 : 200-5
Article dans une revue
voir la publicationCompetitive outcome of multiple infections in a behavior-manipulating virus/wasp interaction
Ecology and Evolution . 5 ( 24 ) : S934-S945
DOI: 10.1002/ece3.1749
Article dans une revue
voir la publicationGenome reduction and potential metabolic complementation of the dual endosymbionts in the whitefly Bemisia tabaci
BMC Genomics . 16 : 226
Article dans une revue
voir la publicationThe Recent Evolution of a Maternally-Inherited Endosymbiont of Ticks Led to the Emergence of the Q Fever Pathogen, Coxiella burnetii
PLoS Pathogens . 11 ( 5 )
Article dans une revue
voir la publicationTwo Host Clades, Two Bacterial Arsenals: Evolution through Gene Losses in Facultative Endosymbionts.
Genome Biology and Evolution . 7 ( 3 ) : 839-855
DOI: 10.1093/gbe/evv030
Article dans une revue
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