Equipe Génétique et Evolution des Interactions

Membres

Les systèmes vivants sont constitués d’une multitude de niveaux d'organisation imbriqués, impliquant coopération et conflits. La coopération et la sélection de systèmes fonctionnant de manière coordonnée a permis des transitions évolutives dites “majeures”, vers de nouvelles échelles d'individualité, comme la cellule eucaryote. Néanmoins, la sélection naturelle continue à opérer à toutes les échelles, générant de possibles conflits évolutifs entre les différentes composantes de l’individu.

Nos recherches s’inscrivent dans cette perspective, et visent à mieux comprendre la nature et les implications évolutives des interactions entre les multiples composantes des organismes, du gène aux bactéries symbiotiques, en passant par les virus et les éléments transposables. Nous explorons également l’impact de ces interactions sur la dynamique de l’information génétique, à travers le transfert horizontal, ou sur l’innovation génétique et l’adaptation, à travers la domestication. Nos recherches, essentiellement expérimentales, mais également théoriques, sont mises en œuvre sur des modèles arthropodes, et relèvent principalement de la génétique et la génomique évolutive.

L'équipe est structurée en deux grands axes:

  • Interactions intra-génomiques : les éléments transposables (resp. Marie Fablet)
    • Ex1: La dynamique évolutive des éléments transposables (ET) dans les génomes, en lien avec leur variabilité naturelle. Nous utilisons pour modèles des populations naturelles de Drosophila melanogaster et D. simulans, ainsi que des espèces d’intérêt agronomique ou sociétal, telles que l’espèce envahissante D. suzukii ou le moustique tigre Aedes albopictus.
    • Ex2: Les interactions entre le contrôle des ET et l’immunité anti-virale. Nous étudions les mécanismes moléculaires d’interférence ARN à l’origine de l’intrication de ces deux processus, ainsi que les implications co-évolutives, à l’aide d’infections expérimentales de différents virus sur plusieurs lignées de drosophiles.
    • Personnes impliquées : CV, MB, MF
  • La symbiose, moteur de l’évolution (resp. Natacha Kremer)
    • Ex1: Certaines bactéries symbiotiques apportent des capacités métaboliques dont l’insecte est dépourvu. Nous analysons ces interactions chez des insectes hématophages (punaise de lits, tiques) et phytophages (l’aleurode Bemisia tabaci) par des approches combinant analyse des phénotypes, génétique, physiologie et métabolomique.
    • Ex2: Les insectes parasitoïdes ont domestiqué des gènes viraux leur permettant de contourner les réponses immunitaire de leurs hôtes. Nous étudions la fréquence et la signification adaptative de ces évènements et, plus généralement, nous recherchons les facteurs structurant les transferts horizontaux dans les communautés hôtes-parasitoïdes.
    • Personnes impliquées : NK, LM, LZ, JMD, JV, FV, SC

 

 

 

 

Publications

Affichage des publications 181 à 210 sur 445 au total

The Aculeata of French Polynesia. III. Sphecidae, with the record of three new species for the Society Islands (Hymenoptera)

Thibault Ramage, Sylvain Charlat, Frédéric Jacq

Bulletin de la Société Entomologique de France . 120 ( 2 ) : 157-163

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Detection of genetically isolated entities within the Mediterranean species of Bemisia tabaci: new insights into the systematics of this worldwide pest

Laurence Mouton, Olivier Gnankiné, Hélène Henri, Gabriel Terraz, Guillaume Ketoh, Thibaud Martin...

Pest Management Science . 71 ( 3 ) : 452-458

DOI: 10.1002/ps.3834

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Parasite-Parasite Interactions in the Wild: How To Detect Them?

Eléonore Hellard, David Fouchet, Fabrice Vavre, Dominique Pontier

Trends in Parasitology .

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Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) host-plant variants: two host strains or two distinct species?

Pascaline Dumas, Fabrice Legeai, Claire Lemaitre, Erwan Scaon, Marion Orsucci, Karine Labadie...

Genetica . 143 ( 3 ) : 305-316

DOI: 10.1007/s10709-015-9829-2

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De novo assembly and annotation of the Asian tiger mosquito (Aedes albopictus) repeatome with dnaPipeTE from raw genomic reads and comparative analysis with the yellow fever mosquito (Aedes aegypti).

Clément Goubert, Laurent Modolo, Cristina Vieira, Claire Valientemoro, Patrick Mavingui, Matthieu Boulesteix

Genome Biology and Evolution . 7 ( 4 ) : 1192-205

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De novo assembly and annotation of the Asian tiger mosquito (Aedes albopictus) repeatome with dnaPipeTE from raw genomic reads and comparative analysis with the yellow fever mosquito (Aedes aegypti)

Clément Goubert, Laurent Modolo, Cristina Vieira, Claire Valiente Moro, Patrick Mavingui, Matthieu Boulesteix

Genome Biology and Evolution . 7 ( 4 ) : 1192-1205

DOI: 10.1093/gbe/evv050

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The chemistry of negotiation: Rhythmic, glycan-driven acidification in a symbiotic conversation

Julia Schwartzman, Eric Koch, Elizabeth Heath-Heckman, Lawrence Zhou, Natacha Kremer, Margaret Mcfall-Ngai...

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 112 ( 2 ) : 566 - 571

DOI: 10.1073/pnas.1418580112

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Nuclear and cytoplasmic differentiation among Mediterranean populations of Bemisia tabaci : testing the biological relevance of cytotypes

Gabriel Terraz, Gwenaelle Gueguen, Judit Arnó, Frédéric Fleury, Laurence Mouton

Pest Management Science . 70 ( 10 ) : 1503-1513

DOI: 10.1002/ps.3792

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Nuclear and cytoplasmic differentiation among Mediterranean populations of Bemisia tabaci : testing the biological relevance of cytotypes

Gabriel Terraz, Gwénaelle Gueguen, Frédéric Fleury, Laurence Mouton, Judit Arnó

Pest Management Science . 70 ( 10 ) : 1503-1513

DOI: 10.1002/ps.3792

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The Genome of Cardinium cBtQ1 Provides Insights into Genome Reduction, Symbiont Motility, and Its Settlement in Bemisia tabaci

Diego Santos-Garcia, Pierre-Antoine Rollat-Farnier, Francisco Beitia, Einat Zchori-Fein, Fabrice Vavre, Laurence Mouton...

Genome Biology and Evolution . 6 ( 4 ) : 1013-1030

DOI: 10.1093/gbe/evu077

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Variable expression levels detected in the Drosophila effectors of piRNA biogenesis

Marie Fablet, Abdou Akkouche, Virginie Braman, Cristina Vieira

Gene . 537 ( 1 ) : 149-153

DOI: 10.1016/j.gene.2013.11.095

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Host Control of Insect Endogenous Retroviruses: Small RNA Silencing and Immune Response

Marie Fablet

Viruses . 6 : 4447-4464

DOI: 10.3390/v6114447

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Wolbachia Divergence and the Evolution of Cytoplasmic Incompatibility in Culex pipiens

Célestine Atyame Nten, Pierrick Labbe, Emilie E. Dumas, Pascal Milesi, Sylvain Charlat, Philippe Fort...

PLoS ONE . 9 ( 1 ) : e87336

DOI: 10.1371/journal.pone.0087336

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A Genome-Wide Survey of Genetic Instability by Transposition in Drosophila Hybrids

Doris Vela, Antonio Fontdevila, Cristina Vieira, García Guerreiro María Pilar

PLoS ONE . 9 : 87 - 87

DOI: 10.1371/journal.pone.0088992.s005

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Could interallelic interactions be a key to the epigenetic aspects of fitness-trait inbreeding depression?

C. Biemont, Cristina Vieira

Heredity . 112 : 219-20

DOI: 10.1038/hdy.2013.80

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Microbial impacts on insect evolutionary diversification: from patterns to mechanisms

Fabrice Vavre, Natacha Kremer

Current Opinion in Insect Science . 4 : 29--34

DOI: 10.1016/j.cois.2014.08.003

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Epidemiology of asexuality induced by the endosymbiotic Wolbachia across phytophagous wasp species: host plant specialization matters.

Thomas Boivin, Hélène Henri, Fabrice Vavre, Cindy Gidoin, Philippe Veber, Jean-Noël Candau...

Molecular Ecology Notes . 23 ( 9 ) : 2362-2375

DOI: 10.1111/mec.12737

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Signs of Neutralization in a Redundant Gene Involved in Homologous Recombination in Wolbachia Endosymbionts

Myriam Badawi, Isabelle Giraud, Fabrice Vavre, Pierre Grève, Richard Cordaux

Genome Biology and Evolution . 10 ( 6 ) : 2654-2664

DOI: 10.1093/gbe/evu207

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Manipulation of arthropod sex determination by endosymbionts: diversity and molecular mechanisms

Wen-Juan Ma, Fabrice Vavre, Leo W. Beukeboom

Sexual Development . : 59-73

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The Evolution of Sex Ratio Distorter Suppression Affects a 25 cM Genomic Region in the Butterfly Hypolimnas bolina

Emily A Hornett, Bruce Moran, Louise A Reynolds, Sylvain Charlat, Samuel Tazzyman, Nina Wedell...

PLoS Genetics . 10 ( 12 ) : e1004822

DOI: 10.1371/journal.pgen.1004822

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The Drosophila Su(var)3–7 Gene Is Required for Oogenesis and Female Fertility, Genetically Interacts with piwi and aubergine, but Impacts Only Weakly Transposon Silencing

Denis Basquin, Anne Spierer, Flora Begeot, Dmitry E Koryakov, Anne-Laure Todeschini, Stéphane Ronsseray...

PLoS ONE . 9 ( 5 ) : e96802

DOI: 10.1371/journal.pone.0096802

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Genomic regions harboring insecticide resistance-associated Cyp genes are enriched by transposable element fragments carrying putative transcription factor binding sites in two sibling Drosophila species

Claudia M A Carareto, Eric H Hernandez, Cristina Vieira

Gene . 537 ( 1 ) : 93-99

DOI: 10.1016/j.gene.2013.11.080

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The oxidative environment: a mediator of interspecies communication that drives symbiosis evolution

Y. Moné, David Monnin, Natacha Kremer

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 281 ( 1785 ) : 20133112 - 20133112

DOI: 10.1098/rspb.2013.3112

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A model symbiosis reveals a role for sheathed-flagellum rotation in the release of immunogenic lipopolysaccharide

Caitlin Brennan, Jason Hunt, Natacha Kremer, Benjamin Krasity, Michael Apicella, Margaret Mcfall-Ngai...

eLife . 3

DOI: 10.7554/eLife.01579

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The dual nature of haemocyanin in the establishment and persistence of the squid - vibrio symbiosis

Natacha Kremer, Julia Schwartzman, Rene Augustin, Lawrence Zhou, Edward G. Ruby, Stéphane Hourdez...

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 281 ( 1785 ) : 20140504

DOI: 10.1098/rspb.2014.0504

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Exposure to hycanthone alters chromatin structure around specific gene functions and specific repeats in Schistosoma mansoni.

David Roquis, Julie M. J. Lepesant, Emanuel Villafan, Jérôme Boissier, Cristina Vieira, Celine Cosseau...

Frontiers in Genetics . 5 : 207

DOI: 10.3389/fgene.2014.00207

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Specific Activation of an I-Like Element in Drosophila Interspecific Hybrids

Elias a G Carnelossi, Emmanuelle Lerat, Hélène Henri, Sonia Martinez, Claudia M A Carareto, Cristina Vieira

Genome Biology and Evolution . 6 : 1806 - 1817

DOI: 10.1093/gbe/evu141

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The Genome of Cardinium cBtQ1 Provides Insights into Genome Reduction, Symbiont Motility, and Its Settlement in Bemisia tabaci

Diego Santos-Garcia, Pierre-Antoine Rollat-Farnier, Francisco Beitia, Einat Zchori-Fein, Fabrice Vavre, Laurence Mouton...

Genome Biology and Evolution . 6 ( 4 ) : 1013-1030

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The sublethal effects of deltamethrin on Trichogramma behaviors during the exploitation of host patches

Jean-Marie Delpuech, Maxime Delahaye

Science of the Total Environment . 447 : 274-279

DOI: 10.1016/j.scitotenv.2012.12.096

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The influence of male wing shape on mating success in Drosophila melanogaster

Bf. Menezes, Fm. Vigoder, Aa. Peixoto, J. Varaldi, Bc. Bitner-Mathé

Animal Behaviour . 85 : 1217--1223

DOI: 10.1016/j.anbehav.2013.03.008

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