Equipe Génétique et Evolution des Interactions

Membres

Les systèmes vivants sont constitués d’une multitude de niveaux d'organisation imbriqués, impliquant coopération et conflits. La coopération et la sélection de systèmes fonctionnant de manière coordonnée a permis des transitions évolutives dites “majeures”, vers de nouvelles échelles d'individualité, comme la cellule eucaryote. Néanmoins, la sélection naturelle continue à opérer à toutes les échelles, générant de possibles conflits évolutifs entre les différentes composantes de l’individu.

Nos recherches s’inscrivent dans cette perspective, et visent à mieux comprendre la nature et les implications évolutives des interactions entre les multiples composantes des organismes, du gène aux bactéries symbiotiques, en passant par les virus et les éléments transposables. Nous explorons également l’impact de ces interactions sur la dynamique de l’information génétique, à travers le transfert horizontal, ou sur l’innovation génétique et l’adaptation, à travers la domestication. Nos recherches, essentiellement expérimentales, mais également théoriques, sont mises en œuvre sur des modèles arthropodes, et relèvent principalement de la génétique et la génomique évolutive.

Ces interactions sont abordées dans l’équipe à différentes échelles :

  • Interactions entre loci au sein des génomes (intra-génomique) (CV, MF, MB), à travers la dynamique évolutive des éléments transposables, étudiée dans les populations naturelles de Drosophila melanogaster et D. simulans, ainsi que des espèces d’intérêt agronomique ou sociétal, telles que l’espèce envahissante D. suzukii ou le moustique tigre Aedes albopictus.
  • Interactions et co-évolution entre hôtes eucaryotes et symbiotes bactériens manipulant sa reproduction ou apportant des capacités métaboliques dont l’insecte hôte est dépourvu (LM, NK, FV, LZ). Nous analysons ces interactions chez des insectes hématophages (la punaise de lit, Cimex lectularius) et phytophages (l’aleurode Bemisia tabaci et la drosophile D. suzukii) par des approches combinant génétique, physiologie et métabolomique.
  • Interactions entre les organismes (simples ou composites) et leurs environnements biotiques ou abiotiques (NK, LZ, MB, LM, FV, JMD, JV, MF). Par exemple, l’impact immuno-régulateur des symbiotes bactériens et des éléments transposables est évalué dans des contextes d’infection par des virus pathogènes. Ces recherches reposent entre autres sur des expériences d’évolution expérimentale de populations de drosophiles et de transcriptomique. L’impact des insecticides ou de stress oxydants est également étudié sur différents modèles (drosophiles, parasitoïdes, punaise de lit).
  • Interactions entre organismes ou consortium d’organismes à l’échelle des communautés (JV, MB, SC), notamment chez des insectes parasitoïdes ayant domestiqué des gènes viraux, leur permettant de contourner les réponses immunitaires de leurs hôtes. Nous étudions la fréquence et les implications adaptatives de ces événements et, recherchons plus généralement les facteurs structurant les transferts horizontaux dans les communautés hôtes-parasitoïdes.

Publications

Affichage des publications 1 à 30 sur 371 au total

Cytotype Affects the Capability of the Whitefly Bemisia tabaci MED Species To Feed and Oviposit on an Unfavorable Host Plant

Sylvain Benhamou, Isabelle Rahioui, Hélène Henri, Hubert Charles, Pedro da Silva, Abdelaziz Heddi...

mBio .

DOI: 10.1128/mBio.00730-21

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Biopesticide Evaluation from Lab to Greenhouse Scale of Essential Oils Used against Macrosiphum euphorbiae

Lana Dunan, Tara Malanga, Philippe Bearez, Sylvain Benhamou, Lucie Monticelli, Nicolas Desneux...

Agriculture . 11 ( 9 ) : 867

DOI: 10.3390/agriculture11090867

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CPCN - BILAN DE MANDATURE 2016 – 2021

Olivier Coutard, Pierre-Olivier Amblard, Claude Amra, Brigitte Bacroix, Pascal Barone, Yannick Barthe...

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Infections by Transovarially Transmitted DMelSV in Drosophila Have No Impact on Ovarian Transposable Element Transcripts but Increase Their Amounts in the Soma

Marlène Roy, Barbara Viginier, Camille Mayeux, Maxime Ratinier, Marie Fablet

Genome Biology and Evolution . 13 ( 9 )

DOI: 10.1093/gbe/evab207

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Natural Selection beyond Life? A Workshop Report

Sylvain Charlat, André Ariew, Pierrick Bourrat, María Ferreira Ruiz, Thomas Heams, Philippe Huneman...

Life . 11 ( 10 ) : 1051

DOI: 10.3390/life11101051

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The Worldwide Invasion of Drosophila suzukii Is Accompanied by a Large Increase of Transposable Element Load and a Small Number of Putatively Adaptive Insertions

Vincent Mérel, P. Gibert, Inessa Buch, Valentina Rodriguez Rada, Arnaud Estoup, Mathieu Gautier...

Molecular Biology and Evolution . 38 ( 10 ) : 4252-4267

DOI: 10.1093/molbev/msab155

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Phenotypic and Transcriptomic Responses to Stress Differ According to Population Geography in an Invasive Species

Pierre Marin, Angelo Jaquet, Justine Picarle, Marie Fablet, Vincent Merel, Marie-Laure Delignette-Muller...

Genome Biology and Evolution . 13 ( 9 ) : evab208

DOI: 10.1093/gbe/evab208

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CPCN - BILAN DE MANDATURE 2016 – 2021

Olivier Coutard, Pierre-Olivier Amblard, Claude Amra, Brigitte Bacroix, Pascal Barone, Yannick Barthe...
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The molecular mechanisms that determine different degrees of polyphagy in the Bemisia tabaci species complex

Osnat Malka, Ester Feldmesser, Sharon Brunschot, Diego Santos‐garcia, Wen‐hao Han, Susan Seal...

Evolutionary Applications . 14 ( 3 ) : 807-820

DOI: 10.1111/eva.13162

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DROP: Molecular voucher database for identification of Drosophila parasitoids

Chia-Hua Lue, Matthew Buffington, Sonja Scheffer, Matthew Lewis, Tyler Elliott, Amelia Lindsey...

Molecular Ecology Resources .

DOI: 10.1111/1755-0998.13435

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Wolbachia load variation in Drosophila is more likely caused by drift than by host genetic factors

Alexis Bénard, Hélène Henri, Camille Noûs, Fabrice Vavre, Natacha Kremer

Peer Community in Evolutionary Biology .

DOI: 10.1101/2020.11.29.402545

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Chromosomal scale assembly of parasitic wasp genome reveals symbiotic virus colonization

Jérémy Gauthier, Hélène Boulain, Joke van Vugt, Lyam Baudry, Emma Persyn, Jean-Marc Aury...

Communications Biology . 4 ( 1 )

DOI: 10.1038/s42003-020-01623-8

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The worldwide invasion of Drosophila suzukii is accompanied by a large increase of transposable element load and a small number of putatively adaptive insertions

Vincent Mérel, Patricia Gibert, Inessa Buch, Valentina Rodriguez-Rada, Arnaud Estoup, Mathieu Gautier...

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Drosophila suzukii oxidative stress response involves Jheh gene cluster but not transposable elements

Pierre Marin, Angelo Jacquet, Hélène Henri, Patricia Gibert, Cristina Vieira

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Portiera Gets Wild: Genome Instability Provides Insights into the Evolution of Both Whiteflies and Their Endosymbionts

Diego Santos-Garcia, Natividad Mestre-Rincon, David Ouvrard, Einat Zchori-Fein, Shai Morin

Genome Biology and Evolution . 12 ( 11 ) : 2107-2124

DOI: 10.1093/gbe/evaa216

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Inside out: microbiota dynamics during host-plant adaptation of whiteflies

Diego Santos-Garcia, Natividad Mestre-Rincon, Einat Zchori-Fein, Shai Morin

ISME Journal . 14 ( 3 ) : 847-856

DOI: 10.1038/s41396-019-0576-8

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Molecular Evolution of the Glutathione S-Transferase Family in the Bemisia tabaci Species Complex

Ofer Aidlin Harari, Diego Santos-Garcia, Mirit Musseri, Pnina Moshitzky, Mitulkumar Patel, Paul Visendi...

Genome Biology and Evolution . 12 ( 2 ) : 3857-3872

DOI: 10.1093/gbe/evaa002

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L’épistémologie des sciences biologiques et géologiques : une occasion d’enseigner l’incertitude ?

Fabienne Paulin, Sylvain Charlat

Raisons éducatives . N°24

DOI: 10.3917/raised.024.0101

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Wolbachia host shifts: routes, mechanisms, constraints and evolutionary consequences

Ehsan Sanaei, Sylvain Charlat, Jan Engelstädter

Biological Reviews .

DOI: 10.1111/brv.12663

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Superparasitism by a parasitoid wasp: The absence of sublethal effects from the neonicotinoid insecticide imidacloprid enlightens the specificity of the cholinergic pathway involved

Jean-Marie Delpuech

Ecotoxicology and Environmental Safety . 201

DOI: 10.1016/j.ecoenv.2020.110809

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How consistent is RAD‐seq divergence with DNA‐barcode based clustering in insects?

Marie Cariou, Hélène Henri, Sonia Martinez, Laurent Duret, Sylvain Charlat

Molecular Ecology Resources . 20 ( 5 ) : 1294-1298

DOI: 10.1111/1755-0998.13178

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Genomic analysis of European Drosophila melanogaster populations reveals longitudinal structure, continent-wide selection, and previously unknown DNA viruses

Martin Kapun, Maite Barrón, Fabian Staubach, Darren Obbard, R Axel W. Wiberg, Jorge Vieira...

Molecular Biology and Evolution . 37 ( 9 ) : 2661-2678

DOI: 10.1093/molbev/msaa120

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Experimental evolution of virulence and associated traits in a Drosophila melanogaster - Wolbachia symbiosis

David Monnin, Natacha Kremer, Caroline Michaud, Manon Villa, Hélène Henri, Emmanuel Desouhant...

Peer Community in Evolutionary Biology .

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Superparasitism by a parasitoid wasp: The absence of sublethal effects from the neonicotinoid insecticide imidacloprid enlightens the specificity of the cholinergic pathway involved

Jean-Marie Delpuech

Ecotoxicology and Environmental Safety . 201 : 110809

DOI: 10.1016/j.ecoenv.2020.110809

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Endosymbiont diversity in natural populations of Tetranychus mites is rapidly lost under laboratory conditions

Flore Zélé, Inês Santos, Margarida Matos, Mylène Weill, Fabrice Vavre, Sara Magalhaes

Heredity . 124 ( 4 ) : 603-617

DOI: 10.1038/s41437-020-0297-9

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Homology-Free Detection of Transposable Elements Unveils Their Dynamics in Three Ecologically Distinct Rhodnius Species

Marcelo Castro, Clément Goubert, Fernando Monteiro, Cristina Vieira, Claudia Carareto

Genes . 11 ( 2 ) : 170

DOI: 10.3390/genes11020170

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Biological Invasion: The Influence of the Hidden Side of the (Epi)Genome

Pierre Marin, Julien Genitoni, Dominique Barloy, Stéphane Maury, Patricia Gibert, Cameron Ghalambor...

Functional Ecology . 34 ( 2 ) : 385-400

DOI: 10.1111/1365-2435.13317

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A transposon story : from TE content to TE dynamic invasion of Drosophila genomes using the single-molecule sequencing technology from Oxford Nanopore

Mohamed Mourdas, Nguyet Dang, Yuki Ogyama, Nelly Burlet, Bruno Mugat, Matthieu Boulesteix...

Cells .

DOI: 10.3390/cells9081776

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Combining sterile and incompatible insect techniques for the population suppression of Drosophila suzukii

K. Nikolouli, F. Sassù, L. Mouton, C. Stauffer, K. Bourtzis

Journal of Pest Science . 93 ( 2 ) : 647 - 661

DOI: 10.1007/s10340-020-01199-6

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