Equipe Génétique et Evolution des Interactions
Membres
Ingénieur d'études CDD
CNRS
Maître de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 16
Post-doc
CNRS
Chargé de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 44 81 01
Chargé de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 43 29 12
Maîtresse de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 16
Professeur des universités
UCBL
Post-doc
CNRS
Doctorante
CNRS
Tél : 04 72 44 81 42
Doctorant
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Post-doc
CNRS
Chargée de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 44 81 01
Doctorante
INSA
Tél : 04 72 44 81 42
Post-doc
UCBL
Maîtresse de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 10
Assistante ingénieure CDD
CNRS
Tél : 04 72 44 81 42
Doctorante
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Doctorante
UCBL
Assistante ingénieure CDD
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Maître de conférences
UCBL
Tél : 33 04 72 44 81 01
Directeur de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 43 19 21
Professeure des universités
UCBL
Tél : 33 04 72 44 82 16
Doctorant
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Professeur des universités
VetAgro-Sup
Tél : 33 04 78 87 27 02
Les systèmes vivants sont constitués d’une multitude de niveaux d'organisation imbriqués, impliquant coopération et conflits. La coopération et la sélection de systèmes fonctionnant de manière coordonnée a permis des transitions évolutives dites “majeures”, vers de nouvelles échelles d'individualité, comme la cellule eucaryote. Néanmoins, la sélection naturelle continue à opérer à toutes les échelles, générant de possibles conflits évolutifs entre les différentes composantes de l’individu.
Nos recherches s’inscrivent dans cette perspective, et visent à mieux comprendre la nature et les implications évolutives des interactions entre les multiples composantes des organismes, du gène aux bactéries symbiotiques, en passant par les virus et les éléments transposables. Nous explorons également l’impact de ces interactions sur la dynamique de l’information génétique, à travers le transfert horizontal, ou sur l’innovation génétique et l’adaptation, à travers la domestication. Nos recherches, essentiellement expérimentales, mais également théoriques, sont mises en œuvre sur des modèles arthropodes, et relèvent principalement de la génétique et la génomique évolutive.
L'équipe est structurée en deux grands axes:
- Interactions intra-génomiques : les éléments transposables (resp. Marie Fablet)
- Ex1: La dynamique évolutive des éléments transposables (ET) dans les génomes, en lien avec leur variabilité naturelle. Nous utilisons pour modèles des populations naturelles de Drosophila melanogaster et D. simulans, ainsi que des espèces d’intérêt agronomique ou sociétal, telles que l’espèce envahissante D. suzukii ou le moustique tigre Aedes albopictus.
- Ex2: Les interactions entre le contrôle des ET et l’immunité anti-virale. Nous étudions les mécanismes moléculaires d’interférence ARN à l’origine de l’intrication de ces deux processus, ainsi que les implications co-évolutives, à l’aide d’infections expérimentales de différents virus sur plusieurs lignées de drosophiles.
- Personnes impliquées : CV, MB, MF
- La symbiose, moteur de l’évolution (resp. Natacha Kremer)
- Ex1: Certaines bactéries symbiotiques apportent des capacités métaboliques dont l’insecte est dépourvu. Nous analysons ces interactions chez des insectes hématophages (punaise de lits, tiques) et phytophages (l’aleurode Bemisia tabaci) par des approches combinant analyse des phénotypes, génétique, physiologie et métabolomique.
- Ex2: Les insectes parasitoïdes ont domestiqué des gènes viraux leur permettant de contourner les réponses immunitaire de leurs hôtes. Nous étudions la fréquence et la signification adaptative de ces évènements et, plus généralement, nous recherchons les facteurs structurant les transferts horizontaux dans les communautés hôtes-parasitoïdes.
- Personnes impliquées : NK, LM, LZ, JMD, JV, FV, SC
Publications
Affichage des publications 1 à 30 sur 408 au total
The transposable element-rich genome of the cereal pest Sitophilus oryzae
Pré-publication
voir la publicationDating the origin of a viral domestication event in parasitoid wasps attacking Diptera
Pré-publication
voir la publicationTranscriptomic Response to Pyrethroid Treatment in Closely Related Bed Bug Strains Varying in Resistance
Genome Biology and Evolution . 16 ( 8 ) : evae158
DOI: 10.1093/gbe/evae158
Article dans une revue
voir la publicationEpigenetics and genotypic variation
On Epigenetics and Evolution . : 119-151
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationEffects of Arboviral Infections on Transposable Element Transcript Levels in Aedes aegypti
Genome Biology and Evolution . 16 ( 5 ) : evae092
DOI: 10.1093/gbe/evae092
Article dans une revue
voir la publicationHuman-aided dispersal and population bottlenecks facilitate parasitism escape in the most invasive mosquito species
PNAS Nexus . 3 ( 5 ) : 175
Article dans une revue
voir la publicationA novel and diverse family of filamentous DNA viruses associated with parasitic wasps
Virus Evolution . 10 ( 1 ) : veae022
DOI: 10.1093/ve/veae022
Article dans une revue
voir la publicationDevelopment, feeding, and sex shape the relative quantity of the nutritional obligatory symbiont Wolbachia in bed bugs
Frontiers in Microbiology . 15 : 1386458
Article dans une revue
voir la publicationCommunity structure of heritable viruses in a Drosophila-parasitoids complex
Peer Community Journal . 4 : e16
Article dans une revue
voir la publicationIdentification and quantification of transposable element transcripts using Long-Read RNA-seq in Drosophila germline tissues
Peer Community Journal . 4 ( e89 )
Article dans une revue
voir la publicationPlant choice for oviposition in the phytophagous insect Bemisia tabaci: cytotype, including symbionts, knows best!
Animal Behaviour . 200 : 147-157
Article dans une revue
voir la publicationThe for gene as one of the drivers of foraging variations in a parasitic wasp
Molecular Ecology . 32 ( 7 ) : 1760-1776
DOI: 10.1111/mec.16834
Article dans une revue
voir la publicationPlant choice for oviposition in the phytophagous insect Bemisia tabaci: cytotype, including symbionts, knows best!
Animal Behaviour . 200 : 147-157
Article dans une revue
voir la publicationStudy of host-symbionts coevolution in the whitefly Bemisia tabaci: an experimental evolution approach
13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA) .
Acte de congrès
voir la publicationSecondary symbionts influence feeding and oviposition behavior in the whitefly Bemisia tabaci
XII European Congress of Entomology .
Poster
voir la publicationThe for gene as one of the drivers of foraging variations in a parasitic wasp
Molecular Ecology . 32 ( 7 ) : 1760-1776
DOI: 10.1111/mec.16834
Article dans une revue
voir la publicationA comprehensive evolutionary scenario for the origin and neofunctionalization of the Drosophila speciation gene Odysseus (OdsH)
G3 . 14 ( 3 ) : jkad299
Article dans une revue
voir la publicationA major 6 Mb superlocus is involved in pyrethroid resistance in the common bed bug Cimex lectularius
Evolutionary Applications . 16 ( 5 ) : 1012 - 1028
DOI: 10.1111/eva.13550
Article dans une revue
voir la publicationNutritional symbioses in triatomines: who is playing?
Peer Community In Evolutionary Biology . : 100629
Article dans une revue
voir la publicationImpact of Heat Stress on Transposable Element Expression and Derived Small RNAs in Drosophila subobscura
Genome Biology and Evolution . 15 ( 11 ) : evad189
DOI: 10.1093/gbe/evad189
Article dans une revue
voir la publicationA quantitative, genome-wide analysis in Drosophila reveals transposable elements’ influence on gene expression is species-specific
Genome Biology and Evolution . 15 ( 9 ) : evad160
DOI: 10.1093/gbe/evad160
Article dans une revue
voir la publicationChimeraTE: a pipeline to detect chimeric transcripts derived from genes and transposable elements
Nucleic Acids Research . 51 ( 18 ) : 9764-9784
DOI: 10.1093/nar/gkad671
Article dans une revue
voir la publicationPlant choice for oviposition in the phytophagous insect Bemisia tabaci: cytotype, including symbionts, knows best!
Animal Behaviour . 200 : 147-157
Article dans une revue
voir la publicationEndoparasitoid lifestyle promotes endogenization and domestication of dsDNA viruses
eLife . 12 : e85993
DOI: 10.7554/eLife.85993
Article dans une revue
voir la publicationRNA Viruses Are Prevalent and Active Tenants of the Predatory Mite Phytoseiulus persimilis (Acari: Phytoseiidae)
Microbial ecology .
Article dans une revue
voir la publicationThe for gene as one of the drivers of foraging variations in a parasitic wasp
Molecular Ecology . 32 ( 7 ) : 1760-1776
DOI: 10.1111/mec.16834
Article dans une revue
voir la publicationGenomic changes during the evolution of the Coxiella genus along the parasitism-mutualism continuum
Peer Community Journal . 3 : e41
Article dans une revue
voir la publicationSex differences in adult lifespan and aging rate across mammals: A test of the ‘Mother Curse hypothesis’
Mechanisms of Ageing and Development . 212 : 111799
Article dans une revue
voir la publicationDes embouchures métalliques de trompettes romaines dans les puits de Troussepoil-Le Bernard (Vendée)
Aquitania . 38 : 353-372
Article dans une revue
voir la publication