Equipe Génétique et Evolution des Interactions
Membres
Ingénieur d'études CDD
CNRS
Maître de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 16
Post-doc
CNRS
Post-doc
CNRS
Chargé de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 43 29 12
Maîtresse de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 16
Professeur des universités
UCBL
Doctorante
CNRS
Tél : 04 72 44 81 42
Doctorant
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Chargée de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 44 81 01
Doctorante
INSA
Tél : 04 72 44 81 42
Maîtresse de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 10
Doctorante
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Doctorante
UCBL
Doctorante
UCBL
Maître de conférences
UCBL
Tél : 33 04 72 44 81 01
Directeur de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 43 19 21
Professeure des universités
UCBL
Tél : 33 04 72 44 82 16
Doctorant
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Professeur des universités
VetAgro-Sup
Tél : 33 04 78 87 27 02
Les systèmes vivants sont constitués d’une multitude de niveaux d'organisation imbriqués, impliquant coopération et conflits. La coopération et la sélection de systèmes fonctionnant de manière coordonnée a permis des transitions évolutives dites “majeures”, vers de nouvelles échelles d'individualité, comme la cellule eucaryote. Néanmoins, la sélection naturelle continue à opérer à toutes les échelles, générant de possibles conflits évolutifs entre les différentes composantes de l’individu.
Nos recherches s’inscrivent dans cette perspective, et visent à mieux comprendre la nature et les implications évolutives des interactions entre les multiples composantes des organismes, du gène aux bactéries symbiotiques, en passant par les virus et les éléments transposables. Nous explorons également l’impact de ces interactions sur la dynamique de l’information génétique, à travers le transfert horizontal, ou sur l’innovation génétique et l’adaptation, à travers la domestication. Nos recherches, essentiellement expérimentales, mais également théoriques, sont mises en œuvre sur des modèles arthropodes, et relèvent principalement de la génétique et la génomique évolutive.
L'équipe est structurée en deux grands axes:
- Interactions intra-génomiques : les éléments transposables (resp. Marie Fablet)
- Ex1: La dynamique évolutive des éléments transposables (ET) dans les génomes, en lien avec leur variabilité naturelle. Nous utilisons pour modèles des populations naturelles de Drosophila melanogaster et D. simulans, ainsi que des espèces d’intérêt agronomique ou sociétal, telles que l’espèce envahissante D. suzukii ou le moustique tigre Aedes albopictus.
- Ex2: Les interactions entre le contrôle des ET et l’immunité anti-virale. Nous étudions les mécanismes moléculaires d’interférence ARN à l’origine de l’intrication de ces deux processus, ainsi que les implications co-évolutives, à l’aide d’infections expérimentales de différents virus sur plusieurs lignées de drosophiles.
- Personnes impliquées : CV, MB, MF
- La symbiose, moteur de l’évolution (resp. Natacha Kremer)
- Ex1: Certaines bactéries symbiotiques apportent des capacités métaboliques dont l’insecte est dépourvu. Nous analysons ces interactions chez des insectes hématophages (punaise de lits, tiques) et phytophages (l’aleurode Bemisia tabaci) par des approches combinant analyse des phénotypes, génétique, physiologie et métabolomique.
- Ex2: Les insectes parasitoïdes ont domestiqué des gènes viraux leur permettant de contourner les réponses immunitaire de leurs hôtes. Nous étudions la fréquence et la signification adaptative de ces évènements et, plus généralement, nous recherchons les facteurs structurant les transferts horizontaux dans les communautés hôtes-parasitoïdes.
- Personnes impliquées : NK, LM, LZ, JMD, JV, FV, SC
Publications
Affichage des publications 1 à 30 sur 390 au total
Transposable element expression is associated with sex chromosome number in humans
PLoS Genetics . 21 ( 6 ) : e1011668
Article dans une revue
voir la publicationContinent-wide differentiation of fitness traits and patterns of climate adaptation among European populations of Drosophila melanogaster
Evolution Letters .
Article dans une revue
voir la publicationExploring the Relationship of Transposable Elements and Ageing: Causes and Consequences
Genome Biology and Evolution . 17 ( 6 )
DOI: 10.1093/gbe/evaf088
Article dans une revue
voir la publicationTransposable elements as evolutionary driving force to host shift in cactophilic Drosophila species
Pré-publication
voir la publicationExploring the role of transposable elements to sex gap in longevity in Drosophila species
Pré-publication
voir la publicationDating the origin of a viral domestication event in parasitoid wasps attacking Diptera
Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 292 ( 2039 )
Article dans une revue
voir la publicationEpigénétique et Eléments Transposables
Epigénétique en écologie et évolution . 978-1-78948-216-4 : 95-116
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationContribution of variable TE content on phenotype and plasticity in Drosophila melanogaster.
Annual meeting of the Society of Molecular Biology and Evolution (SMBE) .
Acte de congrès
voir la publicationContribution of variable TE content on phenotype and plasticity in Drosophila melanogaster.
Conférence Jacques Monod Life is plastic .
Acte de congrès
voir la publicationFunctional analysis of interactions between bed bugs and their symbionts Wolbachia and BEV-like
International congress of Ecology and Evolution (SFE2) .
Acte de congrès
voir la publicationIntricate interactions between antiviral immunity and transposable element control in Drosophila
Pré-publication
voir la publicationIdentification and quantification of transposable element transcripts using Long-Read RNA-seq in Drosophila germline tissues
Pré-publication
voir la publicationEfficient compartmentalization in insect bacteriomes protects symbiotic bacteria from host immune system
Pré-publication
voir la publicationContribution of variable TE content on phenotype and plasticity in Drosophila melanogaster
International congress of transposable elements .
Poster
voir la publicationContribution of TE to the phenotype and plasticity in Drosophila melanogaster
27th European Drosophila Conference .
Poster
voir la publicationFootprints of worldwide adaptation in structured populations of D. melanogaster through the expanded DEST 2.0 genomic resource
Pré-publication
voir la publicationEfficient compartmentalization in insect bacteriomes protects symbiotic bacteria from host immune system
8th International Symposium on Antimicrobial Peptides .
Poster
voir la publicationInsect population dynamics under Wolbachia-induced cytoplasmic incompatibility: Puzzle more than buzz in Drosophila suzukii
PLoS ONE . 19 ( 3 ) : e0300248
Article dans une revue
voir la publicationThe transposable element-rich genome of the cereal pest Sitophilus oryzae
Pré-publication
voir la publicationTranscriptomic Response to Pyrethroid Treatment in Closely Related Bed Bug Strains Varying in Resistance
Genome Biology and Evolution . 16 ( 8 ) : evae158
DOI: 10.1093/gbe/evae158
Article dans une revue
voir la publicationEpigenetics and genotypic variation
On Epigenetics and Evolution . : 119-151
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationInsect population dynamics under Wolbachia-induced cytoplasmic incompatibility: puzzle more than buzz in Drosophila suzukii
Pré-publication
voir la publicationEffects of Arboviral Infections on Transposable Element Transcript Levels in Aedes aegypti
Genome Biology and Evolution . 16 ( 5 ) : evae092
DOI: 10.1093/gbe/evae092
Article dans une revue
voir la publicationHuman-aided dispersal and population bottlenecks facilitate parasitism escape in the most invasive mosquito species
PNAS Nexus . 3 ( 5 ) : 175
Article dans une revue
voir la publicationA novel and diverse family of filamentous DNA viruses associated with parasitic wasps
Virus Evolution . 10 ( 1 ) : veae022
DOI: 10.1093/ve/veae022
Article dans une revue
voir la publicationDevelopment, feeding, and sex shape the relative quantity of the nutritional obligatory symbiont Wolbachia in bed bugs
Frontiers in Microbiology . 15 : 1386458
Article dans une revue
voir la publicationCommunity structure of heritable viruses in a Drosophila-parasitoids complex
Peer Community Journal . 4 : e16
Article dans une revue
voir la publicationIdentification and quantification of transposable element transcripts using Long-Read RNA-seq in Drosophila germline tissues
Peer Community Journal . 4 ( e89 )
Article dans une revue
voir la publicationTransposable element expression with variation in sex chromosome number: insights into a toxic Y effect on human longevity
Peer Community In Genomics .
Article dans une revue
voir la publicationÉtude des interactions entre la punaise de lit et son symbiote nutritionnel obligatoire, Wolbachia.
Rencontres du Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions (G-RREMI) 2023 .
Acte de congrès
voir la publication